طبق اخبار رسیده، آتنا فرقدانی زندانی سیاسی، برای اعتراض به رعایت نشدن "اصل تفکیک جرایم در زندان"، در اعتصاب غذا بسر می برد.
وی ضمن اعتراض به انتقال زندانیان سیاسی به بند های عمومی از جمله انتقال نگار حائری، حکیمه شکری، رویا صابری نژاد و بسمه جبوری به زندان قرچک ورامین و همچنین اعتراض به انتقال غیرقانونی خودش به این زندان، بازگرداندن هرچه سریعتر زندانیان سیاسی را به زندان اوین خواستار شد.
آتنا فرقدانی در شهریور ۱۳۹۳ به اتهام اقدام علیه امنیت ملی و توهین به نمایندگان مجلس از طریق رسم نقاشی بازداشت شد.

مأموران در هنگام بازداشت آتنا، منزل وی را مورد بازرسی قرار دادند و وسایل شخصی او را ضبط کردند.
او دو ماه در بند دو الف زندان اوین (بازداشتگاه امنیتی سپاه) در حبس بود .طی این مدت تحت فشارهای روحی قرار داشت. وی یک ماه و نیم پس از آغاز بازداشت، دست به اعتصاب غذا زد. آتنا فرقدانی بعد از وخامت وضع جسمی اش به دستور قاضی صلواتی با قرار وثیقه بیش از ده میلیارد ریال تا برگزاری دادگاه از زندان آزاد شد.
آتنا فرقدانی پس از آزادی موقت خود با انتشار ویدیویی گفت که در دوران بازداشتش ، ماموران زن در بازرسی بدنی وی، برخورد نا متعارف و شنیع با او داشته اند.
وی در دوران آزادی موقت خود اعلام داشت نامه های بسیاری به مقام های مسوول در این باره نوشته اما به دلیل پاسخ نگرفتن، ویدیوی زیر را با هدف برداشتن گامی در راه توقف خشونت علیه زنان منتشر کرده است.
وی روز ۲۰ دی ۱۳۹۳ به شعبه ۱۵ دادگاه انقلاب فراخوانده شده بود تا در برابر «ابوالقاسم صلواتی» پاسخ گوی اتهامات خود شود، وی پس از معرفی خود به شعبه ۱۵ دادگاه انقلاب تهران ، در برابر چشم پدر و مادرش مورد ضرب و شتم ماموران قرار گرفت و به زندان قرچک ورامین منتقل شد.
وی مدتی پیش با انتشار متنی دادگاه های ایران را به «بی دادگاه»‌هایی تشبیه کرده بودکه "کفه های ترازوهایش هیچ گاه به تساوی نرسیده است"
در این ارتباط ژیلابنی یعقوب در صفحه فیس بوک خود نوشت:آتنا فرقدانی زندانی سیاسی محبوس در زندان قرچک ورامین، در اعتصاب غذای به سر می برد. در اعتصاب غذای تر معمول این است که به جز آب، زندانی روزی ۹ تا ۱۵ حبه قند (معادل 75گرم) می خورد و همچنین مقداری نمک...، بدون خوردن نمک و قند مغز و کلیه خیلی سریع آسیب می بیند....، اما آتنا از خوردن نمک و قند هم خودداری می کند و هرچقدر هم دوستانش به او اصرار کرده اند که هر روز کمی نمک و چند تا قند بخورد قبول نکرده است و این وضعش را نگران کننده می کند.
خواسته اصلی آتنا از اعتصاب غذایش حتی آزادی نیست، او فقط می گوید من را به زندان اوین بازگردانید، زندانم را عوض کنید،همین.این چیز زیادی است؟!...

آتنا زندانی سیاسی است و طبق اصل تفکیک زندانیان و جرائم باید با زندانیان سیاسی نگه داری شود.
جمعی از فعالان حقوق کودک که در زندان اوین دوران اسارت خود را طی می کنند، طی نامه ای از آتنا فرقدانی خواستند اعتصاب خود را بشکند، در این نامه آمده است:"ما به عنوان دوستان و همراهان شما در کارزار حمایت از کودکان کار و محروم که روزهای خوش و دشواری را برای احقاق حقوق کودکان و ساختن جهانی شایسته کودکان پشت سر گذاشته ایم، از شما تقاضا داریم، اعتصاب خود را شکسته و به صبر و بردباری در مقابل دشواری های راهمان، بسنده کنید که سلامت شما ضمانت بقای راه مشترک همه ماست:
این نامه با امضاء سعید شیرزاد, ئاسو رستمی, امید علیشناس, امیر امیرقلی, آتنا دائمی، محمد سعید حسین زاده موحد، منتشر شده است.